Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms