Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip12G5E870 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip12G5E870 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip12G5E870 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip12G5E870 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trip12G5E870 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trip12G5E870 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trip12G5E870 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms