Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933406M09RikG3XA12 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms