Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms