Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc9a3G3X939 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms