Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SprtnG3X912 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SprtnG3X912 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms