Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34aG3UW52 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms