Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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