Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms