Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp988F6VKC7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp988F6VKC7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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