Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5861F6VCN9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms