Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC067074F6RXI4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC067074F6RXI4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC067074F6RXI4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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