Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf165E9QAU8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms