Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrdnE9Q9K5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms