Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FancfE9Q5Z5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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