Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms