Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp1E9Q368 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms