Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms