Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20425E9Q035 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms