Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms