Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc8E9PWG2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms