Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9008E9PVG0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9008E9PVG0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms