Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc175E9PVB3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms