Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r49D3Z6L3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms