Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20521D3Z5F7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20521D3Z5F7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms