Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms