Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cttnbp2B9EJA2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms