Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clip3B9EHT4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms