Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah3B2RWG3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms