Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms