Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a28B2RT89 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc22a28B2RT89 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms