Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp964B2RR88 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms