Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms