Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CK137956B1AYM9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms