Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd5B1AYB6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd5B1AYB6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms