Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b5A3FIN4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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