Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trgv2A2J008 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms