Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl41A2AUC9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms