Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SktA2AQ25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SktA2AQ25 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms