Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Rtf1A2AQ19 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Rtf1A2AQ19 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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Rtf1A2AQ19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtf1A2AQ19 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms