Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cavin4A2AMM0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms