Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prdm12A2AJ77 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms