Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc27A2A6Q5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms