Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms