Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms