Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trbv2A0A0B4J1G8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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