Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv15A0A0A6YYE3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv15A0A0A6YYE3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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