Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms