Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc166S4R181 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms