Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac5Q9Z2V6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac5Q9Z2V6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms